日军占领东北，上海各大药铺无法从东北购买药材，导致药铺生意受损，夏元为了赚钱和日本人小村森一合作，褚韶华和闻知秋都不同意，闻知秋还在国药公会主席选举的时候投了夏元的反对票，夏元被迫辞职。
夏元要和褚韶华联手把闻知秋赶出闻氏大药房，褚韶华坚持站在闻知秋一边，夏元一气之下就号召上海各大药铺中止和闻氏大药房合作，闻知秋如果不能及时交货，就要面临巨额赔偿。闻知秋不想坐以待毙，就和褚韶华分头行动，他去找药商洽谈，希望他们同意延迟交货，药商们坚决不干，闻知秋面临破产和巨额赔偿。
褚韶华四处寻找货源，他们要么没货，要么就以各种理由给闻氏大药房供货，褚韶华询问得知这一切都是夏元在背后搞鬼。正当闻知秋和褚韶华一筹莫展的时候，田同道主动找闻知秋合作。
闻知秋和褚韶华来见田同道，田同道答应卖药材给他们，竟然狮子大开口要五倍的价钱，褚韶华看出田同道是落井下石，闻知秋不想放弃，他和田同道讨价还价，最后按照原价购买田同道手里的药材，褚韶华被激怒，大骂闻知秋一通，闻知秋就是不肯松口，褚韶华顺手端起一杯茶泼在闻知秋脸上，然后摔门而走。
田同道看不到褚韶华和闻知秋翻脸，开心地合不拢嘴，答应明天就给闻知秋发货。闻知秋送走田同道，赶忙来和褚韶华汇合，这是他们俩联手演的一出戏，故意在田同道面前表演他们反目成仇，田同道果然上当，按照原价卖给闻知秋药材。
转眼到了1932年1月28日，日军战机疯狂轰炸上海，城市被炸得一片狼藉，百姓们吓得四散逃命，褚韶华二话没说就加入救死扶伤的队伍中，她冒着枪林弹雨把伤员抬到救护车上。饭店的伙计们都逃之夭夭，康二妞吓得瑟瑟发抖，孙龙吟参军上前线，临行前他来和康二妞辞行，康二妞劝他不要去冒险，孙龙吟发誓战争结束就回来看康二妞。
上海出在水深火热之中，各大药铺纷纷涨价，大发国难财，夏元不顾梅三度劝阻，把店里的药全部加价销售。褚韶华和闻知秋去前线指挥部送药品和绷带，突然遭遇日军敌机的轰炸，闻知秋拼命保护褚韶华受重伤，褚韶华被炸晕了过去。康二妞的饭店被炸毁，她来不及逃走被埋在废墟里。
褚韶华迷迷糊糊醒来，得知闻知秋头部伤势严重还在昏迷。夏元听说康二妞饭店所在的香山路被炸得很严重，就带梅三度赶过去，饭店的楼顶被炸出一个大窟窿，夏元刚想离开，突然听到废墟中有动静，他看到康二妞的高跟皮鞋，猜到她被埋在里面，就用双手从废墟里把康二妞救出来。
褚韶华伤势渐渐痊愈，闻知秋还是昏迷不醒，褚韶华就寸步不离守在他身边，一连六天过去了，闻知秋还没醒来，褚韶华心急如焚，她想起爷爷曾经讲过万灵丹救醒一个将军的事，褚韶华连夜回药房配置万灵丹，万灵丹一共一百多道工序，缺少一道都不行。
褚韶华用了一整夜时间，终于配制出万灵丹，她第一时间赶到医院喂给闻知秋，医生检查闻知秋还没有醒过来的迹象，劝褚韶华做好最坏的准备，褚韶华想起爷爷曾经说过万灵丹因人而异，她急忙赶回去重新配治，把治好的万灵丹喂给闻知秋，闻知秋还是一动不动。
褚韶华想起闻知秋说过用西医的方法配治重要，她就回去重新配治，终于完成了中西结合的万灵丹，褚韶华喂给闻知秋，看到闻知秋还是无动于衷，褚韶华伤心地痛不欲生，她已经失去的太多，不想再失去闻知秋，褚韶华祈祷闻知秋尽快醒过来，答应嫁给他。
闻知秋突然睁开双眼，褚韶华又惊又喜，闻知秋昏迷了十天，现在终于苏醒过来了。经过褚韶华精心照顾，闻知秋的伤势渐渐好转。褚韶华和闻知秋准备举行婚礼，闻知秋来给夏初扫墓，褚韶华邀请康二妞做伴娘，夏元得知此事，心里愤愤不平，康二妞劝他接受这个事实，夏初已经死了五年了。
褚韶华和闻知秋一起来选西装，伙计带闻知秋进去试衣服，老板一眼就认出褚韶华，褚韶华和夏初五年前去他打工的店里试婚纱，老板清楚地记得夏初被杀当天闻知秋来店里把他叫走，褚韶华不禁大吃一惊，对闻知秋的身份起疑心。
褚韶华去调取了夏初被杀的卷宗，查出穆子儒奉命暗杀夏初，根本不是误杀，褚韶华还在夏初的遗物里找到闻知秋给他的要单子，夏初去康宁诊所拿药的时候被穆子儒枪杀，而且五年前小林就和闻知秋认识，小林经常来闻氏大药房给他奶奶买补脑丹，褚韶华打电话向康二妞打听小林的底细，得知小林的奶奶去世多年。
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